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  • 希望组,与Oxford Nanopore建立战略合作联盟1904

    公司简介
    希望组,全称北京希望组生物科技有限公司(GrandOmics Biosciences Co.,Ltd.),创立于2014年,主要提供基因组学相关产品和服务,旗下包括武汉未来组生物科技有限公司子公司(100%控股)。

    产品服务
    医学检测
    单基因遗传病精准解决方案
    三代全基因组测序—全谱系变异检测
    全外显子组测序
    全基因组测序
    面肩肱型肌营养不良症(FSHD)精准诊断
    个人参考基因组计划
    医学产品
    GrandBox基因分析工作站
    dbSV数据库

    管理团队
    汪德鹏,CEO,1997年毕业于北京大学。
    吴昕,CTO,2005年北京大学生物信息学博士毕业;曾任中通软联开源咨询公司副总裁、孟山都生信科学家等职。
    刘山林,CSO,毕业于哥本哈根大学;曾任华大基因研究院的岗位科学家,并被评为深圳市“孔雀计划”的海外高层次人才、深圳市盐田区高级人才等称号。
    吴婷婷,COO,2001年毕业于南昌大学;曾在华大基因任职。
    梁羽,CMO,2013年获得中科院北京基因组研究所遗传学博士学位。
    Min S. Park,公司研究院院长,1989年获得美国田纳西大学分子生物学博士学位;先后在美国能源部洛斯阿拉莫斯国家实验室、洛斯阿拉莫斯国家实验室、韩国科学技术学院、釜山大学以及中科院水生所等单位任职。

    公司合作
    2019年4月,公司宣布与Oxford Nanopore建立战略合作联盟,共同构建大规模Nanopore测序平台,预计三年内完成10万人Nanopore长读长人类基因组测序dbSV-100K。

    公司融资
    2016年底,公司完成了由经纬中国主领投、赛富投资共领投、清科创投跟投的A轮融资。
    2018年7月,公司完成了近1亿元人民币B轮融资。本轮融资由远毅资本领投,昌平科技产业母基金(昌发展管理基金)和老股东经纬中国跟投。

    参考阅读
    官网 https://www.grandomics.com/
    https://36kr.com/p/5141258

  • 牛津纳米孔,合作希望组共搭Nanopore测序平台1904

    公司合作
    2019年3月,Clear Labs公司同意将牛津纳米孔公司的GridION X5 DNA测序技术整合到其用于食品安全检测病原体和其他污染物的Clear Safety NGS平台中。同样在3月份,牛津纳米孔公司的新R10纳米孔由内部使用交付到早期获取项目中,由此产生的反馈预计将影响产品的最终广泛发布。
    2019年4月,北京希望组(GrandOmics)与Oxford Nanopore建立战略合作联盟,共同构建大规模Nanopore测序平台,预计三年内完成10万人Nanopore长读长人类基因组测序——dbSV-100K。

    企业简介
    牛津纳米孔,全称牛津纳米孔科技有限公司(Oxford Nanopore Technologies Limited)总部位于英国,公司研发生产和销售便携式、实时DNA/RNA测序仪。
    公司在纽约、剑桥(美国)、中国、日本、法国和德国均有设立办公室。

    公司融资
    2018年3月,在新一轮融资中获得了1亿英镑(约1.39亿美元)的投资,参与本轮募资的投资机构包括新加坡政府投资公司(GIC)、建银国际(CCBI)、澳大利亚养老金管理机构HostPlus基金公司,以及部分现有股东。本轮募得资金将用于新生产基地建设、市场拓展、以及新产品研发.
    2018年10月,公司融入安进的一笔5000万英镑(6560万美元)的股权投资。

    公司业绩
    2017年,公司收入1380万英镑(约合1810万美元)

    产品服务
    市场的口袋测序仪MinION和台式测序仪GridION,高通量测序仪产品PromethION以及袖珍型、可用于单次检测的Flongle、手机测序仪SmidgION等。
    MinION 是一款便携式、实时、长读长、低成本设备,旨在让任何人,不论是在科学研究、教育,还是一系列实际应用中,例如疾病/病原体监测、环境监测、食物链监测、自我量化,甚至微重力生物学等领域,都能进行简便的生物分析。自2015年开始销售以来,MinION 已被分布在70 余个国家的科学家们广泛使用,助力于他们的科研工作,实现了在传统实验室内和实地环境下的众多应用。
    GridION X5 是一款配有计算模块的台式测序仪,具有可运行多达五个MinION 测序芯片的能力。此外,另一款具有高通量、高采样数特点的PromethION测序仪已进入客户早期试用阶段。
    PromethION是一款模块化的、按需测序设备,测序能力高于MinION的近300倍。PromethION的设计可运行高达48个测序芯片。在2018年初,利用单个PromethION测序芯片,牛津纳米孔能够产出超过150Gb的数据。使用临床样本、植物样本以及检测样本,用户能够用单个PromethION测序芯片生成70至100Gb的数据。

    参考阅读
    官网 https://nanoporetech.com

  • 王凯(美国宾夕法尼亚大学副教授)

    王凯

    创业经历
    2015年初,曾于汪德鹏联合创立北京希望组生物科技有限公司,并担任公司首席科学家,后担任科学顾问委员会委员。
    2019年6月14日,工商信息显示,王凯从希望组股东会和董事会中退出,个人相关介绍及科研相关成果从希望组公司官网删除。

    科研进展
    2019年6月4日,王凯作为通讯作者在Nature Communications杂志上发表题为“Detection of DNA base modifications by deep recurrent neural network on Oxford Nanopore sequencing data”的研究论文,建立了识别Nanopore表观修饰的深度循环神经网络模型,并开发了相应的软件DeepMod。研究者采用LSTM-RNN深度循环神经网络作为深度学习框架,采取两种独立的策略利用多个Nanopore测序数据集进行训练和校正,完成了5mC和6mA检测模型的建立。

    人物简介
    王凯,美国宾夕法尼亚大学病理系副教授,费城儿童医院细胞与分子治疗中心研究员,Scientific Reports等杂志的编委,从2007年开始,陆续开发和发表了多个工具软件,在各类学术刊物上面发表论文150余篇,涵盖了复杂疾病、罕见单基因病、肿瘤、干细胞、表观遗传学和基因组学大数据分析工具等方向,引用超过25000次。尤其是在长读长(包括PacBio Sequel和Oxford Nanopore等平台)测序领域的技术权威,参与或主持了第一个亚洲人基因组的接近完成图的基因组组装,多种脊髓性脑共济失调疾病的动态突变的定量分析,面肩肱疾病的重复序列的分析,多种不同的DNA修饰和甲基化的发现与定量分析,基于长读长测序的罕见遗传病的致病性结构变异的查找,以及构建基于长读长测序的结构变异的数据库等项目。

    参考阅读
    http://www.seqchina.cn/9805.html