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  • 何川(芝加哥大学)

    学术成果
    表观遗传学领域学术贡献突出。包括了首个RNA去甲基化酶FTO、第二个RNA去甲基化酶ALKBH5,开发了DNA修饰碱基5hmC和6mA等的检测和测序方法。
    2020年4月,团队开发单链DNA测序方法——KAS-seq,KAS-seq可在全基因组范围内快速、敏感地检测和定位由转录或其他过程产生的ssDNA,且只需使用1000个细胞即可实现。该方法基于N3-kethoxal和鸟嘌呤在ssDNA中快速而特异性的反应开发。KAS-seq方法,是一种简单、低起始量、高灵敏度的ssDNA测序方法,可同时检测转录活性、增强子活性以及DNA结构变化,适用于稀有样本的转录动态变化检测。Nature Methods (2020)
    2018年,发现血液中细胞外游离DNA(cfDNA)上的5hmC可作为癌症的生物标记物。将hmC-CATCH应用于人类cfDNA的5hmC测序,首次获得了人类cfDNA的单碱基分辨率图谱,并且通过hmC-CATCH测序结果可以将癌症病人与正常人区分开。
    2014年,m6A去甲基化酶FTO(Jia et al.Nature Chemical Biology2011)和ALKBH5(Zheng et al.Molecular Cell2013)的发现,拓展和丰富了RNA m6A甲基化表观转录组学新概念与研究领域(Niu et al. GPB 2013; Zheng et al.RNA Biology2013)。相对于m6A去甲基化酶的发现,催化m6A形成以SAM为甲基供体的甲基转移酶复合物(~1000kDa)的发现进展缓慢,70-kDA METTL3(methyltransferase like 3)亚基是目前唯一已知组分。M6A甲基转移酶复合物各组分的发现和鉴定,对揭示RNA m6A甲基化表观转录组学功能和调控规律极其重要。 发现了M6A甲基转移酶复合物另外两个重要蛋白METTL14(methyltransferase like 14)和WTAP, METTL14、WTAP和METTL3在体内形成功能复合物,催化m6A形成。
    2012年,发现和鉴定了第二个m6A去甲基化酶-与FTO同属加双酶AlkB家族的ALKBH5,进一步证实了可逆m6A甲基化调控mRNA表达水平和RNA代谢过程;ALKBH5敲除小鼠生精小管细胞中mRNA的m6A甲基化水平升高,同时引起睾丸萎缩,精子数量减少,质量下降,生育率下降等病变,证实ALKBH5介导的RNA m6A去甲基化调控精子发育等重要生理功能。

    成长经历
    何川(chuan he),贵州出生,中国科技大学应用化学毕业(89级),2000年获得MIT博士学位。美国科学促进会会士(AAAS Fellow),美国芝加哥大学John T. Wilson讲座教授,美国霍华德休斯医学院(HHMI) 研究员。“未来科学大奖”发起人,科学委员会委员及生命科学奖评委,保罗.马克斯癌症研究奖获得者(2017)。主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修饰,尤其是5hmC修饰等方面获得了许多重要的发现。曾荣获美国癌症研究青年科学家奖,以及凯克基金会医学研究杰出青年学者奖等多个奖项,HHMI研究员。

    科学家培养
    陈鹏(北大化学与分子工程学院 教授,国家杰青)、杨财广(中科院药物所PI,入选科技部中青年科技创新领军人才计划)、伊成器(北京大学研究员)、刘建钊(浙大高分子科学与工程学系研究员)、张俊良(华东师范大学化学与分子工程学院副院长)等。

    关联企业
    上海易毕恩基因科技有限公司
    美国Accent Therapeutics公司

    相关阅读
    个人简介 http://he-group.uchicago.edu/
    http://chemistry.uchicago.edu/fac/he.shtml
    https://chuansongme.com/n/1647019951231
    https://www.nature.com/articles/s41592-020-0797-9

  • 易毕恩基因,与罗氏诊断、贝克曼库尔特建示范实验室181128

    易毕恩(EPN),全称上海易毕恩基因科技有限公司,2015年11月在上海注册成立,2017年全职29人。创始人何川,实际控制人不详,天使轮维亚生物投资,A轮引入同华资本投资,B轮引入红杉资本。主要提供5hmC开展肿瘤早筛技术服务。

    发展历程
    2011年6月,初代研究性产品授权美国Active Motif公司开发上市
    2014年6月,与美国芝加哥大学医学院及斯隆-凯特琳癌症中心完成老鼠模型测试
    2015年11月,公司团队落地上海张江,获得美国芝加哥大学全球独家授权临床产品开发,获得第一轮天使投资。
    2017年5月,承担科技部“十三五”“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”重大专项公司,同时引入B轮红杉投资
    2017年7月,首个利用表观遗传学的肝癌临床检测产品开发完成
    2018年2月,首个基于表观遗传学的多癌种液体活检筛查产品开发完成
    2018年,战略并购合肥中科金臻

    创始人
    何川,美国芝加哥大学化学系教授、John T.Wilson讲席教授、2013年入选美国霍华德休斯医学院(HHMI) 研究员,2017年荣获保罗.马克斯癌症研究奖。
    1994年,中国科技大学学士;2000年,MIT博士;2000-2002年,哈佛大学博士后;2002-2008年,芝加哥大学教授助理;2008-2010年,芝加哥大学副教授;2010年至今,芝加哥大学教授。
    学术相关 https://chemistry.uchicago.edu/faculty/chuan-he

    产品服务
    健康人群癌症早筛、临床癌症辅助诊断、术后癌症跟踪监测。

    专利情况
    国外专利 Compositions and Methods Related to Modi cation of 5-Hydroxymethylcytosine (5-hmC)
    CN201610119096.2 DNA5-甲基胞嘧啶与5-羟甲基胞嘧啶基因图谱测序方法
    CN201610119392.2 微量DNA 中甲基化CpG 岛高通量测序方法
    CN201710020252.4 用于筛选肠癌和/或胃癌的基因标志物的方法、用该方法筛选的基因标志物及其用途

    企业合作
    2018年11月28日,公司与罗氏诊断、贝克曼库尔特在上海共同举办“表观遗传学肿瘤早筛领域临床转化高峰论坛”并进行“贝克曼库尔特-易毕恩-罗氏诊断示范实验室”揭牌仪式,宣布示范实验室落地张江高新技术产业开发区青浦园区。

    相关阅读
    http://www.epican.cn/
    Song, C.-X.; Szulwach, K. E.; Fu, Y.; Dai, Q.; Yi, C.; Li, X.; Chen, C.-H.; Zhang, W.; Jian, X.; Wang,J.; Zhang, L.; Looney, T. J.; Zhang, B.; Godley, L. A.; Hicks, L. M.; Lahn, B. T.; Jin, P.; He, C. “Selective chemical labeling reveals the genome-wide distribution of 5-hydroxymethylcytosine” Nat. Biotechnol. 2011, 29, 68-72.