分类: 人工智能

  • GANs,新改进有望提高医学影像图片识别190702

    技术简介
    GANs(生成对抗网络,Generative adversarial networks),是换脸软件DeepFakes背后的算法,具有合成高逼真图像的能力,也是当前非常流行的一种深度学习算法。2019年7月2日,改进的GANs被吕贝克大学的研究者用于医学影像图片的分析中。

    技术挑战

    深度学习算法在图像模式匹配方面表现出色,可被应用于在CT扫描中检测不同类型的癌症,鉴别磁共振成像中的疾病、识别x射线的异常。但主要面临两大挑战。
    一是隐私问题,研究人员往往没有足够的测试数据,通过“生成对抗网络”合成更多与真实图像难以区分的医学图像,有效地增加所需数据的数量;另外一方面深度学习算法需要对高分辨率图像进行训练,才能产生最佳预测,然而合成这样的高分辨率图像,尤其是3D图像,需要大量的计算能力。这意味着这项应用对硬件要求颇高。这也是GANs在医学影像图片处理应用较少的原因。

    技术改进

    吕贝克大学的Hristina Uzunova等人分解了图像生成的过程分,先利用GAN生成低分辨率图像,然后在正确的分辨率下每次生成一小部分的细节图像,这种方法不仅生成了逼真的高分辨率2D和3D图像,乃至可以生成任意大小的图片,且无需支出额外费用,当然需要更多的GPU。

    相关阅读
    https://arxiv.org/abs/1907.01376
    https://www.technologyreview.com/f/613924/ai-deepfakes-gans-medical-cancer-diagnosis/

  • 汇健科技,华大旗下奇迹之光领投、岩木草投资跟投1902

    汇健科技,全称杭州汇健科技有限公司,是一家医疗器械研发型公司。公司于2016年11月17日在杭州滨江成立,由邬建敏创立,2017年底全职人员8人,资产总额222.2万元,营业收入4.7万元(工商2017年年报)。

    企业融资
    2016年,公司获得杭州蓝智投资天使轮融资;
    2018年7月,公司获得芜湖福健A轮融资;
    2019年2月,公司完成由华大旗下奇迹之光基金领投、岩木草投资跟投的Pre A轮投资,本轮融资将重点用于产品研发、肿瘤样本数据库及生产基地建设。

    管理团队
    邬建敏,创始人,硕士期间开始从事生物传感器方面的技术研究,应用领域也是医疗诊断方面。博士期间攻读了环境生物学方向的博士学位。2007-08年,美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)高级访问学者,期间接触到了半导体纳米材料技术,归国后开始展开相应的研究,尝试将半导体纳米材料技术与质谱技术结合在一起,并应用于临床诊断。
    任亮,总经理,分子生物学研究生学历,主管运营。在加入汇健科技之前,任亮先后在生物医药企业和投资机构积累了多年的工作经验。
    余捷凯,博士,副总,主管医学与生信,曾在浙大医学院肿瘤研究所工作。
    栾春燕,香港城市大学材料学专业博士,主管汇健科技的研发部工作。

    技术思路
    利用质谱技术开展多类型靶标检测,汇健科技研发耗材及芯片+分析软件扩展了MALDI-TOF的临床应用场景。
    对标公司美国的biodesix,该公司开发的其中一款肺癌检测产品(Biodesix Lung Reflex),借助质谱来同时检测血液中多个多肽标志物。
    液体活检在肿瘤检测应用,主要通过检测血液中的CTC(循环肿瘤细胞)和ctDNA(循环肿瘤DNA)来对肿瘤的分子分型和发展状况进行判断。质谱技术的特点在于它是一种多组学技术,可以用于检测核酸、多肽、细胞代谢物等多种不同的检测靶标。将质谱技术应用于液体活检,最大的优势在于可以对病症进行多靶标同时检测。

    基于纳米材料+液态火箭的质谱分析流程

    其中所使用的质谱技术平台是MALDI-TOF-MS(基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱),早在1975年,质谱技术就已经用于细菌鉴定,1996年通过MALDI-TOF-MS获得了细菌的全部指纹图谱。目前MALDI-TOF-MS主要作为细菌等微生物鉴定和基因分型的工具,其中该类型的仪器在微生物检测方面已经进入了临床检验科室。基因检测方面,对SNP检测优势在于检测准确性高,通量高,一个反应可检测30个位点,检测时间短;在DNA甲基化定量检测方面,MALDI-TOF的优势在于准确性高,检测片段覆盖较长,可达400-600bp,成本低。除此以外,MALDI-TOF也可以用于临床方面检测,例如耳聋基因检测、HPV基因检测、个体化用药基因检测以及疾病预警基因检测。该技术成像存在不足:主要在边缘电场效应造成整靶板电场的非均一性、成像速度耗时较长、空间分辨率有限、灵敏度有限。

    产品思路
    其主打产品是用于质谱液体活检的血清肽谱检测试剂盒及分析软件。该试剂盒内的Bio-pSi纳米芯片捕获的主要目标是血液中的多肽。这些多肽一般分子量在20KD以下,比血浆中的背景蛋白要小得多而且丰度极低。如肿瘤进展中,往往伴随着蛋白酶(如MMPs等)表达的变化。而蛋白酶的核心功能就是降解细胞内外环境中的各种蛋白成分。因此由疾病引起的蛋白酶表达情况变化势必会影响血液中的多肽组成。
    Bio-pSi纳米颗粒能从复杂的血清样本中富集低丰度的肽类物质,捕获到纳米孔道当中的多肽分子可以很容易地被浓缩富集,并且能够有效地防止肽段被血液中的蛋白酶降解。随后,在MALDI-TOF-MS平台上使用公司的颗粒原位质谱检测(OPMD)技术可实现血清肽谱的快速分析。结合特征质谱峰及人工神经网络软件生成的预测模型,可实现肿瘤的诊断,复发转移监测及药物疗效评价。

    可能的竞争优势
    市场对高性价比国产MALDI-TOF质谱仪器设备的需求;
    材料技术+MALDI-TOF-MS的多技术组合及人才配套。

    相关资料来源
    国家企业信用信息公示系统
    https://www.sohu.com/a/294737243_115035
    https://www.biodesix.com/
    http://www.kepu.gov.cn/www/article/dtxw/f3babc7092184119b1dfd4631932e95c
    https://vcbeat.net/ZWUwMGZmMGJkYTk2NGVkNjE0N2VhMjQyNzc5MmE3Y2Y=
    http://www.well-healthcare.com/

  • Enpicom,传统行业软件开发商迎来新发展完成A轮1903

    公司简介
    Enpicom是一家生物医学软件开发公司,成立于2015年,总部位于荷兰北布拉班特,专注于为免疫治疗开发人员提供软件技术支持。

    公司简介
    Enpicom是一家生物医学软件开发公司,成立于2015年,总部位于荷兰北布拉班特,专注于为免疫治疗开发人员提供软件技术支持。

    公司融资
    2019年3月,Enpicom完成A轮120万欧元融资,由BOM Brabant Ventures领投,Nextgen Ventures和Arches Capital跟投,所融资金将用于ImmunoGenomix(IGX)平台的开发以及市场推广。

    产品服务
    2017年中期,Enpicom开发了ImmunoGenomix(IGX)平台,这是市场上第一个全套测序数据分析平台,可用于管理、储存、分析和解释T细胞和B细胞受体库的克隆测序数据。目前,该公司正处于ImmunoGenomix(IGX)平台全球推广准备工作的最后阶段。

    技术优势
    “在研究免疫系统相关疾病或开发相关药物时,能够直接测量并密切监测细胞状态极为重要。汇编测序是一种高效的方式,能快速分析数十万甚至数百万T细胞或B细胞受体。我们很高兴完成了A轮融资,新的资金可以加快我们ImmunoGenomix(IGX)平台的完成并开展相应的市场推广计划。”–Nicola Bonzanni博士(公司销售总监)
    “Enpicom团队创新性地将数据科学与医学结合,他们打造的IGX平台将对社会产生巨大影响力。该平台能为创新生命科学公司和医疗保健供应商提供有效工具,方便他们测量患者免疫系统状态,为患者提供有效的治疗。”–Sjoerd van Gorp(BOM Brabant Ventures投资经理)。